Родился в семье прибалтийских немцев.
Работал на «Ленфильме». Знаменитая эмблема студии «Медный всадник» была создана художником Мариной Бологовской и оператором Эдгаром Штырцкобером.
В середине 1940-х получил 10 лет лагерей: сгорела некая лаборатория, где он вёл съёмки — и вот уже кинооператор на воркутинских шахтах.
Благополучно пережив этот непростой период своей жизни, Штырцкобер после освобождения работал на киностудии «Таллинфильм», потом немного в Ленинграде и в итоге перебрался в Москву.